ניסוי במעבדת ליפידים
תוכן עניינים
Ceramide synthetze
על מנת לסנטז את הספינגוליפיד ceramide משתמשים בשני סובסטראטים - ספינגוזין וחומצת שומן ובאנזים ספציפי לסינטיזה. ישנה קבוצת אנזימים הנקראים cers (צראמיד סינטאטז) ומסומנים כ- CERS1 - CERS6. כל אחד מהאנזימים הללו יודע לעבוד עם טווח של חומצות שומניוצת באורך מסוים ולסייע בחיבור שלהן לספינגוזין. האנזים הספציפי CERS2 הוא האנזים שבאופן סלקטיבי פועל על החומצות השומניות בעלות 22 ו- 24 פחמצנים.
עכברי knockout ועכברי null
על מנת להתחקות אחר יצור הצראמיד וההשלכות על תפקידיו, משתמשים בעכברים שבהם הגן ליצירת האנזים CERS2 לא פעיל (הומוזיגוטים לגן הרצסיבי)- עכברי knockout. או בעכברים שבהם בבדרך שונה מנעים את ביטוי של הגן ואת יצירתו של האנזים הנ"ל.
סימון רדיואקטיבי לספינגוזין
על מנת לסמן רדיואקטיבית את הספינגוזין, משתמשים בספינגונין בעל קשר כפול, ומגיבים אותו סודיום בורוהידראט NaBH4 , שבו המימנים הם איזוטופים רדעיואקטיביים - טריטיום. מה שמתרחש הינו הרוויה של הקשר הכפול במימנים בעלי פעילות רדיואקטיבית.
הסינטיזה האנזימטית
משתמשים במיצוי מכבד של עכבר רגיל או עכבר null. לשני המיצויים הנ"ל מוסיפים את הספינגוזין המסומן רדיואקטיבית וחומצת השומן. מאחר והאנזים בסביבה מימית, והסובסטראטים הינם שומניים,משתמשים בומוגנייזר, שבנוי משברי ממברנות, ומקבלים כך סביבה קולאידית אחידה שבה האנזים והסובסטראט יכולים לבוא במגע. עצירת התגובה נעשית ע"י תערובת כלורופורם ומתנול
מעקב אחר תוצרי התגובה
הבדיקה של תוצר הסינטיזה היא ע"י TLC - כרומטוגרפיה על שכבה דקה של סיליקה, כאשר הנוזל המריץ הוא תערובת נוזלים א-פולאריים. כדי להכין את תערובת התגובה להטענה על פלטת ה- TLC:
- מנדפים אתת תערובת הכלורופורם/מתנול.
- מוסיפים כלורופורם כדי למצות את החומרים השומניים לפאזה אורגנית.
- מבצעים הפרדה בצנטריפוגה ומסלקים את הנוזל העליון המימי.
- את הפאזה האורגנית מערבבים היטב - ומטעינים על פלטת ה- TLC וממתינים לנידוף הכלורופורם.
בדיקות לאחר ההרצה
בעזרת יוד שמסתפח לקשרים כפולים ניתן לסמן אצראמיד והספינגוזין. ולכן מכניסים את הפלטות אחרי ההרצה לתא שבו גבישי ואדי יוד. מופיעים כתמים צהובים. בעזרת פילם שרגיש לקרינת ביתא - שנפלטת מהחומר המסומן רדיואקטיבית ניתן לזהות בפלטה את כתמי הצראמיד וכתמי הספינגוזין שלא הגיב.
